南天宮於清同治二年(西元 1863 年)，在萊園村萊園路57巷2號以土埆磚建築、蓋薄瓦屋頂，之後日治時代則改建為木造棟樑、蓋亞鉛板屋頂平房，主神奉祀天上聖母，就是信眾所通稱的媽祖婆，而南天宮開基媽祖與霧峰林家有很深的淵源：當時林文察為陸路提督，奉命帶領將兵赴台時，依照民間習俗從漳州奉請天上聖母金尊庇護隨行，在勦匪平亂後，將媽祖暫時安奉於林家大廳，爾後為應族親和信眾敬拜，林文察的母親戴太夫人就在「下厝」「宮保第」後面搭建安奉場所、建造廟宇，將媽祖安奉在村民俗稱的「庄內公廳」中，供族人和信眾膜拜。

民國五十九年，媽祖顯赫托夢，發動地方募捐並成立興建委員會，但是所募款額僅新台幣數萬元難以進行重建廟宇的鉅資工程，然而在老五媽會會員另組籌備委員會、分組募款後，終於湊足款額完成大殿 ( 媽祖殿 ) 工程，之後鐘鼓樓、管理委員會辦公室、玉皇殿、觀音殿、聖母殿等相繼在各方信眾的善心捐獻下興建完成、入火安座。另外聖母正殿有雕飾非常精緻、巧奪天工的「八卦堵」，令人讚嘆不已。

南天宮正殿祀奉媽祖，左右是隨侍在天上聖母旁的順風耳和千里馬，而左側神壇則是奉祀城隍爺和福德正神，右邊則是太歲星君；除此之外，亦奉祀中壇元帥三太子、觀世音菩薩、藥師佛、巧聖仙師 ( 魯班 ) 、註生娘娘、玉皇大帝、三官大帝、玄天上帝、文昌帝君、關聖帝君等神明，信眾絡繹不絕、香火鼎盛。
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