艋舺清水巖又稱「祖師廟」，在清乾隆52年(西元1787年)建立。與艋舺龍山寺、大龍峒保安宮，並稱「臺北三大廟門」。主祀的清水祖師陳昭應是福建安溪移民從故鄉請來，共有7尊，其中以蓬萊祖師最靈，也就是所稱的「落鼻祖師」。相傳天災地變時，祖師的鼻子就會自行掉下來，警告信徒，一直到災變過去，才又會自行回復。

祖師廟歷史悠，久在前殿中門前，有一對粗壯的龍柱；而兩側的山牆，有18世紀末、19世紀初的磚雕圖案，是廟中現存最古老的藝術品。此外，在樑架、石壁、龍柱上，也都刻有清朝的帝號年代，都是渾厚樸拙的作品，所以祖師廟曾被稱為表現清代中期最具特色和藝術水準的台灣廟宇。此廟在日治時代，曾設洲立二中，即今成功中學之前身。