芝山文化生態綠園位於陽明醫院對面，園區內除了有水生池、百年楓香樹等自然景物外，芝山岩展示館一樓設置了360°的環景模型，述說芝山岩與周圍台北城的發展與地緣關係，並有詳細的文獻資料來介紹芝山岩的人文歷史與自然生態。

生態暖房區也培育了許多在地的原生植物，並讓遊客可以透過水族缸，近距離觀察樹蛙等生物。還有考古探坑教室，能讓觀眾參觀現地展示，發現考古發掘的各文化層剖面。這裡也是認識台北過往文化的歷史生態區。