蓮花池又名蓮華池位於魚池鄉五城村，在日據時代又名「藥草森林」，蓮花池海拔750公尺，佔地約500公頃，是台灣中、低海拔動植物最豐富的地區，由於此處土地大多屬於研究中心的保護區，再加上位於明潭抽蓄水力發電廠上游，所以並沒有被過度的開發，是遠離塵囂、洗滌心靈的世外桃源，因此有人稱蓮花池為日月潭的秘密花園。
蓮花池原始林木種類繁多，其中有許多都是國寶級的保育類樹木，前來知識之旅或芬多精之旅的遊客也請多加疼惜這裏的一草一木。

蓮華池園內有台灣的高等植物物種，也有外來栽培物種154種，現在是台灣中部低海拔地區碩果僅存的一片較完整的天然林區。林區裡的台灣稀有植物「觀音座蓮」及「菱形奴草」是最為珍貴。

神奇的菱形奴草是一年生的寄生植物，它不含葉綠素，具有地下莖，寄生在其它植物的根上，葉子呈鱗片狀，有約8～ 12對組成菱形柱狀體，故名之。
菱形奴草為台灣特有種，就分布和數量而言，它屬於分布狹小的特有種。根據調查文獻記載，菱形奴草僅在南投縣魚池鄉蓮華池發現約30個小族群，均寄生在別的植物根上，因為數量稀少恐有滅絕危機。