慈祐宮，相傳創建於康熙二十五年(1686年)，雍正九年(1731)重修，改稱為"慈祐宮"，後分別曾於乾隆、嘉慶、咸豐、同治、光緒、日治時期、光復後進行重修，現正進行第十次整修。民國七十四年，慈祐宮被列入台閩地區第三級古蹟。

慈祐宮是一座面寬三開間四進兩廊式平面配置廟宇，坐北朝南，呈街屋型長條狀配置，計有前埕、前殿、內埕及牆廊，拜殿及正殿、中內埕及牆廊、後殿、後內埕及牆廊、開山殿及後花園等。

慈祐宮正殿祀媽祖，左側配祀伽藍王爺，右側配祀福德正神；後殿祀觀音佛祖，左右配祀達摩祖師、註生娘娘；開山殿供奉歷代祖師與住持僧侶之牌位。媽祖不僅是航海者的守護神，更是新莊人精神上安全的寄託，因此慈祐宮與新莊人有著化不開之情。
宮內生態活現的雕龍畫棟，塑造精巧細膩的鳳鳥花木、故事人像及前殿神社龍雕工等，均為極具藝術價值的古蹟，宮內並保有乾隆、嘉慶以下口匾、古碑、木刻楹聯等文物甚多，歷史價值極高，值得參訪細細欣賞。

除上述歷史藝術精品外，慈祐宮中較具特色尚有一前埕花崗岩，為昔日廟前碼頭挖取舖設。千里眼、順風耳戴官帽、著官服、上靴子，不同於一般媽祖廟之配祀。前殿左右兩壁，現存碑記七件，多為修建碑記，最早為乾 隆二十九年(1764年)所立的"聖母香燈奉憲立石"碑；另有匾額式碑記，刻有財產目錄及媽祖田地圖，為本省罕見。

前殿蟠龍圓柱石獅，造型雅緻，風格獨具，為嘉慶時期石雕作品。正殿前殿的蟠龍柱，特色獨具，為當時大陸石師傳雕成後運送來台，全省僅有二對，另一對在台南天后宮。
後花園鎮火池，為往昔房屋因緊臨且建材易燃，在殿後開闢池塘以為鎮火，亦喻為美人照鏡、倒照觀音。當時後村圳以北尚無建物，黃昏時鎮火池倒映觀音山影，為新莊八大景之一。儘管在新莊街日益繁榮，古味漸失的今天，新莊市民仍對慈祐宮保有一貫虔誠的信仰，慈祐宮冥冥中護祐著牠的子民能不遜於往昔的繁榮、富足景象。