早期來台移民，大多從鹿港起岸至溪北，有張、陳兩姓及族人，沿由大肚溪口登岸水裡港從事拓殖，並從大陸祖廟請三府王爺隨傳庇佑。至乾隆元年(一七三六)村民集資建廟奉祀。咸豐八年(一八五八)，時隔一百二十餘年之久，前所用建材大多腐化，由總理張明月、副總理張基保、張老獅、郭王景等倡議予以重修。從此香火更為鼎盛。光緒年間，張氏二人中武舉人，還願匾額二面現存廟內，該廟奉祀三府王爺歷史悠久，不但為王爺廟進香中心亦為沿海地區僅有之道教聖蹟。