日治時期大正9年（1920）12月15日，彰化至清水間完工通車，清水站即開辦客貨運輸之營業。大正11年10月11日，竹南至清水間完工通車，鐵路即成為往來清水地區的主要交通運輸工具。

昭和10年（1935）4月21日，中部大地震，站房全部傾倒，同年12月就地重建，原日人設計之日式木質結構，改採用鋼筋水泥材料，翌年5月竣工。廊下列柱採縮柱式，外牆以溝紋面磚貼飾，呈現樸素的美感，鑄鐵型椅架曲線流暢優美，烘托出古典氛圍。民國90年10月7日，清水站建築經民眾票選，得票名列全國第二，入選為臺中縣歷史建築十景之一，92年4月，登錄公告為縣定歷史建築。

清水火車站因距離清水街區較遠，無公車轉運至市區，都須靠計程車接駁，乘車旅客人數不若沙鹿、大甲等其它海線車站來得多，但大部份的清水人長途遠行都會選擇搭乘火車。從清水站北上至台中港站（甲南站），沿線右側順著壯闊的清水橫山，左側則是五福圳及ㄧ望無際的田園景觀，真是賞心悅目。

清水火車站在現任顏站長認真經營之下，加上地方熱心人士協助下，洋溢著文藝氣息的城鄉風貌，整潔明亮的空間，流暢的空氣和動線，豐富的相關資訊，賞心悅目的植栽，別出新栽的創意作品，給予旅客優雅、溫馨的感受，充分顯示出小城小站的特色。