過牛頭山一帶之後，公路折向綠島北岸，逐漸下降至海岸平原的公館村。史載清嘉慶9年(1804)，屏東小琉球人陳必先首登綠島，建一芧屋名為「公館」，即此處地名之由來。公館村一帶海岸也呈海灣地形，東端海岬為牛頭山，西端為公館鼻。灣內除珊瑚裙礁外，也有數個集塊岩海蝕柱，形態各異，其中一塊形如頭戴戰盔，身披冑甲，面海而立的武士，人稱「將軍岩」。其後另有一塊類似面海好久不見了，低首佇足的少婦，人稱「望夫岩」。
　　公館聚落東邊的流麻溝溪，發源於阿眉山，為綠島最長的溪流，流長不過2公里。然溪水下切台地作用劇烈，形成既深又的溪壑，呈連續S型河道蜿蜒而上，相當壯觀。昔日溪中盛產鱸鰻，故名「鱸鰻溝」，後來才演變「流麻溝」。此處地形險惡，相傳是百餘年漢人與雅美族人爭單的最後戰場，雅美人戰敗後即退居蘭嶼。也因為兩岸陡峭，斧斤難入，溪壑中原生植群未遭破壞，為綠島保留一處碩果僅存的熱帶季風雨林。林內可發現綠島較特殊的蝴蝶如琉璃帶鳳蝶、江崎黃蝶、黑點大白斑蝶、小黃紋?蝶，以及鳥類如領角鴞、角鴞、紅頭綠鳩、棕耳鵯等。惟近年在此設立水壩，供作綠島飲用水來源，原有景觀生態已大受影響。

　　公館至柴口、中寮間北海岸，是綠島海岸平原面積最廣之處，地形較為單調。海岸地形仍是以珊瑚裙礁為主體，柴口與中寮則是綠島砂丘發育最佳之處，也是綠島僅有２處砂灘之一。這一線上是各類監獄、管訓隊分布地，著名的異議人士如柏楊（郭衣洞）、施明德等皆曾在此留下身影。如今政治犯雖已成過去，來自全台各地的角頭老大仍是此地的要客，民國87年(1998)，亞洲第一座人權紀念碑於公館公園預定地動土，以人權教育基金會董事長柏楊、立委施明德為代表的近百名受害者皆應邀觀禮，象徵舊時代傷痛的結束，與新世紀的來臨。